Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRIG2O94898 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIG2O94898 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms