Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCTN3O75935 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN3O75935 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms