Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASSF9O75901 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms