Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSDE1O75534 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSDE1O75534 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms