Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH4O75427 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH4O75427 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms