Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
VAMP4O75379 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VAMP4O75379 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms