Protein–RNA interactions for Protein: O75185

ATP2C2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2O75185 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C2O75185 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C2O75185 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C2O75185 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms