Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG13O75143 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG13O75143 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG13O75143 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG13O75143 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG13O75143 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG13O75143 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG13O75143 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG13O75143 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG13O75143 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG13O75143 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG13O75143 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG13O75143 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG13O75143 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG13O75143 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG13O75143 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG13O75143 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG13O75143 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG13O75143 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG13O75143 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms