Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOX15O60248 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOX15O60248 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOX15O60248 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOX15O60248 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX15O60248 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX15O60248 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX15O60248 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX15O60248 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOX15O60248 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SOX15O60248 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms