Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA2O43921 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA2O43921 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA2O43921 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms