Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EDIL3O43854 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms