Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGTAO43765 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGTAO43765 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGTAO43765 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGTAO43765 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGTAO43765 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGTAO43765 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGTAO43765 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGTAO43765 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGTAO43765 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGTAO43765 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGTAO43765 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGTAO43765 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGTAO43765 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGTAO43765 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGTAO43765 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGTAO43765 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGTAO43765 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGTAO43765 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGTAO43765 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGTAO43765 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGTAO43765 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGTAO43765 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGTAO43765 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGTAO43765 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGTAO43765 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGTAO43765 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGTAO43765 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGTAO43765 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGTAO43765 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGTAO43765 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGTAO43765 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGTAO43765 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGTAO43765 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGTAO43765 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGTAO43765 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms