Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH3O43739 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH3O43739 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms