Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUV39H1O43463 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUV39H1O43463 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUV39H1O43463 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms