Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1E1O43324 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1E1O43324 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1E1O43324 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1E1O43324 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1E1O43324 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1E1O43324 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1E1O43324 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1E1O43324 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEF1E1O43324 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1E1O43324 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1E1O43324 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEF1E1O43324 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms