Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DYNC1LI2O43237 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1LI2O43237 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI2O43237 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms