Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOX3O15254 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOX3O15254 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOX3O15254 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms