Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA5O15230 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms