Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD28O15084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD28O15084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms