Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDKO14874 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDKO14874 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms