Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBAG9O00559 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms