Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD2O00469 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms