Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3FO00303 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3FO00303 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms