Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFXAPO00287 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFXAPO00287 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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