Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01387J3KSC0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms