Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms