Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms