Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMX3A6NHT5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms