Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNDIG1LA6NDD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1LA6NDD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms