Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3AA6NCI4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms