Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC78A2IDD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC78A2IDD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms