Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLRN2A0PK11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLRN2A0PK11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLRN2A0PK11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms