Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms