Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL2-SNX15V9GYD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL2-SNX15V9GYD0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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