Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQ87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U3KQ87 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U3KQ87 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U3KQ87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQ87 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQ87 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQ87 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQ87 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQ87 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U3KQ87 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQ87 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQ87 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQ87 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQ87 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U3KQ87 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQ87 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQ87 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQ87 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQ87 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQ87 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQ87 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQ87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQ87 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQ87 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQ87 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQ87 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQ87 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQ87 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQ87 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQ87 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U3KQ87 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQ87 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U3KQ87 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U3KQ87 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQ87 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQ87 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQ87 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQ87 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQ87 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U3KQ87 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQ87 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQ87 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQ87 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQ87 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQ87 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQ87 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQ87 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQ87 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQ87 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQ87 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQ87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQ87 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQ87 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQ87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQ87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U3KQ87 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQ87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQ87 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQ87 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQ87 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQ87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQ87 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQ87 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQ87 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQ87 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQ87 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQ87 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQ87 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQ87 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQ87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQ87 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQ87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQ87 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U3KQ87 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U3KQ87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQ87 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQ87 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQ87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQ87 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQ87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQ87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U3KQ87 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQ87 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQ87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQ87 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQ87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQ87 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQ87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQ87 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQ87 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQ87 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQ87 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQ87 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KQ87 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U3KQ87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQ87 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQ87 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQ87 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQ87 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms