Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN7Q9Y6W3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN7Q9Y6W3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN7Q9Y6W3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN7Q9Y6W3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN7Q9Y6W3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN7Q9Y6W3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN7Q9Y6W3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN7Q9Y6W3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN7Q9Y6W3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN7Q9Y6W3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN7Q9Y6W3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN7Q9Y6W3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN7Q9Y6W3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN7Q9Y6W3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN7Q9Y6W3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN7Q9Y6W3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN7Q9Y6W3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN7Q9Y6W3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN7Q9Y6W3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN7Q9Y6W3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN7Q9Y6W3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN7Q9Y6W3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN7Q9Y6W3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN7Q9Y6W3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAPN7Q9Y6W3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAPN7Q9Y6W3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN7Q9Y6W3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN7Q9Y6W3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN7Q9Y6W3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN7Q9Y6W3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN7Q9Y6W3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN7Q9Y6W3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN7Q9Y6W3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN7Q9Y6W3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN7Q9Y6W3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN7Q9Y6W3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN7Q9Y6W3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms