Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX8Q9Y5X2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNX8Q9Y5X2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX8Q9Y5X2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX8Q9Y5X2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX8Q9Y5X2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX8Q9Y5X2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX8Q9Y5X2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX8Q9Y5X2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX8Q9Y5X2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX8Q9Y5X2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX8Q9Y5X2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX8Q9Y5X2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX8Q9Y5X2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX8Q9Y5X2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX8Q9Y5X2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX8Q9Y5X2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX8Q9Y5X2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX8Q9Y5X2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX8Q9Y5X2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX8Q9Y5X2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX8Q9Y5X2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX8Q9Y5X2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX8Q9Y5X2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX8Q9Y5X2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms