Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF2Q9Y5W3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF2Q9Y5W3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF2Q9Y5W3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLF2Q9Y5W3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF2Q9Y5W3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLF2Q9Y5W3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLF2Q9Y5W3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KLF2Q9Y5W3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF2Q9Y5W3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF2Q9Y5W3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF2Q9Y5W3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLF2Q9Y5W3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF2Q9Y5W3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF2Q9Y5W3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF2Q9Y5W3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF2Q9Y5W3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF2Q9Y5W3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLF2Q9Y5W3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLF2Q9Y5W3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLF2Q9Y5W3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF2Q9Y5W3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF2Q9Y5W3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF2Q9Y5W3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF2Q9Y5W3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF2Q9Y5W3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF2Q9Y5W3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF2Q9Y5W3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF2Q9Y5W3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF2Q9Y5W3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF2Q9Y5W3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLF2Q9Y5W3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF2Q9Y5W3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF2Q9Y5W3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLF2Q9Y5W3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLF2Q9Y5W3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF2Q9Y5W3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLF2Q9Y5W3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF2Q9Y5W3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF2Q9Y5W3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF2Q9Y5W3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLF2Q9Y5W3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF2Q9Y5W3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF2Q9Y5W3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms