Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRELID3BQ9Y3B1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRELID3BQ9Y3B1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRELID3BQ9Y3B1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRELID3BQ9Y3B1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRELID3BQ9Y3B1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRELID3BQ9Y3B1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRELID3BQ9Y3B1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID3BQ9Y3B1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID3BQ9Y3B1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRELID3BQ9Y3B1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID3BQ9Y3B1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRELID3BQ9Y3B1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRELID3BQ9Y3B1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRELID3BQ9Y3B1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRELID3BQ9Y3B1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRELID3BQ9Y3B1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRELID3BQ9Y3B1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRELID3BQ9Y3B1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRELID3BQ9Y3B1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRELID3BQ9Y3B1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRELID3BQ9Y3B1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRELID3BQ9Y3B1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRELID3BQ9Y3B1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRELID3BQ9Y3B1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRELID3BQ9Y3B1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRELID3BQ9Y3B1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms