Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIKFYVEQ9Y2I7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIKFYVEQ9Y2I7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIKFYVEQ9Y2I7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIKFYVEQ9Y2I7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIKFYVEQ9Y2I7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIKFYVEQ9Y2I7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIKFYVEQ9Y2I7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIKFYVEQ9Y2I7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIKFYVEQ9Y2I7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIKFYVEQ9Y2I7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIKFYVEQ9Y2I7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PIKFYVEQ9Y2I7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIKFYVEQ9Y2I7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIKFYVEQ9Y2I7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms