Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC4Q9Y296 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC4Q9Y296 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC4Q9Y296 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC4Q9Y296 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC4Q9Y296 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC4Q9Y296 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC4Q9Y296 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC4Q9Y296 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC4Q9Y296 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC4Q9Y296 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC4Q9Y296 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC4Q9Y296 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC4Q9Y296 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC4Q9Y296 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC4Q9Y296 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC4Q9Y296 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC4Q9Y296 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC4Q9Y296 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC4Q9Y296 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC4Q9Y296 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC4Q9Y296 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC4Q9Y296 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC4Q9Y296 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC4Q9Y296 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC4Q9Y296 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC4Q9Y296 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC4Q9Y296 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC4Q9Y296 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms