Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX7Q9UNH6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX7Q9UNH6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX7Q9UNH6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX7Q9UNH6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX7Q9UNH6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX7Q9UNH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX7Q9UNH6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX7Q9UNH6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX7Q9UNH6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX7Q9UNH6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX7Q9UNH6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX7Q9UNH6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX7Q9UNH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX7Q9UNH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX7Q9UNH6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX7Q9UNH6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX7Q9UNH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX7Q9UNH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX7Q9UNH6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX7Q9UNH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX7Q9UNH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX7Q9UNH6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX7Q9UNH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX7Q9UNH6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX7Q9UNH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX7Q9UNH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX7Q9UNH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX7Q9UNH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX7Q9UNH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX7Q9UNH6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX7Q9UNH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX7Q9UNH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX7Q9UNH6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX7Q9UNH6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX7Q9UNH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms