Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RARRES3Q9UL19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES3Q9UL19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARRES3Q9UL19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARRES3Q9UL19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARRES3Q9UL19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARRES3Q9UL19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES3Q9UL19 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES3Q9UL19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARRES3Q9UL19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARRES3Q9UL19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARRES3Q9UL19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARRES3Q9UL19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARRES3Q9UL19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES3Q9UL19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES3Q9UL19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES3Q9UL19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES3Q9UL19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARRES3Q9UL19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARRES3Q9UL19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARRES3Q9UL19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES3Q9UL19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES3Q9UL19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARRES3Q9UL19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARRES3Q9UL19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARRES3Q9UL19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARRES3Q9UL19 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARRES3Q9UL19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARRES3Q9UL19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARRES3Q9UL19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARRES3Q9UL19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARRES3Q9UL19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RARRES3Q9UL19 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES3Q9UL19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES3Q9UL19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES3Q9UL19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARRES3Q9UL19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARRES3Q9UL19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES3Q9UL19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms