Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP45Q9UL16 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP45Q9UL16 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CFAP45Q9UL16 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP45Q9UL16 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CFAP45Q9UL16 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP45Q9UL16 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CFAP45Q9UL16 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CFAP45Q9UL16 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFAP45Q9UL16 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CFAP45Q9UL16 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CFAP45Q9UL16 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFAP45Q9UL16 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFAP45Q9UL16 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFAP45Q9UL16 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFAP45Q9UL16 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CFAP45Q9UL16 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CFAP45Q9UL16 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CFAP45Q9UL16 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CFAP45Q9UL16 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP45Q9UL16 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP45Q9UL16 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP45Q9UL16 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP45Q9UL16 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CFAP45Q9UL16 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFAP45Q9UL16 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFAP45Q9UL16 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFAP45Q9UL16 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFAP45Q9UL16 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFAP45Q9UL16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFAP45Q9UL16 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFAP45Q9UL16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFAP45Q9UL16 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CFAP45Q9UL16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CFAP45Q9UL16 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CFAP45Q9UL16 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFAP45Q9UL16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFAP45Q9UL16 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFAP45Q9UL16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFAP45Q9UL16 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFAP45Q9UL16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFAP45Q9UL16 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFAP45Q9UL16 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CFAP45Q9UL16 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CFAP45Q9UL16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFAP45Q9UL16 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFAP45Q9UL16 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFAP45Q9UL16 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFAP45Q9UL16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CFAP45Q9UL16 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CFAP45Q9UL16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFAP45Q9UL16 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFAP45Q9UL16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFAP45Q9UL16 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFAP45Q9UL16 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms