Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms