Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2D1Q9UJQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2D1Q9UJQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2D1Q9UJQ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2D1Q9UJQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2D1Q9UJQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2D1Q9UJQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCP2D1Q9UJQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2D1Q9UJQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2D1Q9UJQ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2D1Q9UJQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms