Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL9Q9P2J3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL9Q9P2J3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL9Q9P2J3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL9Q9P2J3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL9Q9P2J3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL9Q9P2J3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL9Q9P2J3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL9Q9P2J3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL9Q9P2J3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL9Q9P2J3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL9Q9P2J3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL9Q9P2J3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL9Q9P2J3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL9Q9P2J3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL9Q9P2J3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL9Q9P2J3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL9Q9P2J3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL9Q9P2J3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL9Q9P2J3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL9Q9P2J3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL9Q9P2J3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms