Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SLAIN2Q9P270 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SLAIN2Q9P270 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SLAIN2Q9P270 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SLAIN2Q9P270 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SLAIN2Q9P270 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SLAIN2Q9P270 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SLAIN2Q9P270 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SLAIN2Q9P270 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SLAIN2Q9P270 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SLAIN2Q9P270 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SLAIN2Q9P270 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SLAIN2Q9P270 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
SLAIN2Q9P270 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
SLAIN2Q9P270 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SLAIN2Q9P270 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SLAIN2Q9P270 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SLAIN2Q9P270 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SLAIN2Q9P270 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SLAIN2Q9P270 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SLAIN2Q9P270 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SLAIN2Q9P270 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SLAIN2Q9P270 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SLAIN2Q9P270 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SLAIN2Q9P270 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SLAIN2Q9P270 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SLAIN2Q9P270 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SLAIN2Q9P270 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SLAIN2Q9P270 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SLAIN2Q9P270 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SLAIN2Q9P270 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SLAIN2Q9P270 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SLAIN2Q9P270 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SLAIN2Q9P270 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SLAIN2Q9P270 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SLAIN2Q9P270 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SLAIN2Q9P270 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SLAIN2Q9P270 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SLAIN2Q9P270 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SLAIN2Q9P270 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SLAIN2Q9P270 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SLAIN2Q9P270 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SLAIN2Q9P270 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SLAIN2Q9P270 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SLAIN2Q9P270 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SLAIN2Q9P270 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SLAIN2Q9P270 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SLAIN2Q9P270 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SLAIN2Q9P270 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
SLAIN2Q9P270 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SLAIN2Q9P270 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SLAIN2Q9P270 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SLAIN2Q9P270 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
SLAIN2Q9P270 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SLAIN2Q9P270 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SLAIN2Q9P270 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SLAIN2Q9P270 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SLAIN2Q9P270 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SLAIN2Q9P270 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SLAIN2Q9P270 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
SLAIN2Q9P270 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SLAIN2Q9P270 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
SLAIN2Q9P270 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SLAIN2Q9P270 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SLAIN2Q9P270 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SLAIN2Q9P270 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SLAIN2Q9P270 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
SLAIN2Q9P270 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SLAIN2Q9P270 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SLAIN2Q9P270 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SLAIN2Q9P270 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SLAIN2Q9P270 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
SLAIN2Q9P270 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SLAIN2Q9P270 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SLAIN2Q9P270 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SLAIN2Q9P270 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SLAIN2Q9P270 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SLAIN2Q9P270 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms