Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM9Q9P0T7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM9Q9P0T7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM9Q9P0T7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM9Q9P0T7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM9Q9P0T7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM9Q9P0T7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM9Q9P0T7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM9Q9P0T7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM9Q9P0T7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM9Q9P0T7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM9Q9P0T7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM9Q9P0T7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM9Q9P0T7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM9Q9P0T7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM9Q9P0T7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM9Q9P0T7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM9Q9P0T7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM9Q9P0T7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM9Q9P0T7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM9Q9P0T7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM9Q9P0T7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM9Q9P0T7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM9Q9P0T7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM9Q9P0T7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM9Q9P0T7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM9Q9P0T7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM9Q9P0T7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM9Q9P0T7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM9Q9P0T7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM9Q9P0T7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM9Q9P0T7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM9Q9P0T7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM9Q9P0T7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms