Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RDH8Q9NYR8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDH8Q9NYR8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH8Q9NYR8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH8Q9NYR8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH8Q9NYR8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH8Q9NYR8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH8Q9NYR8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH8Q9NYR8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH8Q9NYR8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH8Q9NYR8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH8Q9NYR8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH8Q9NYR8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH8Q9NYR8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDH8Q9NYR8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH8Q9NYR8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH8Q9NYR8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH8Q9NYR8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RDH8Q9NYR8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH8Q9NYR8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH8Q9NYR8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH8Q9NYR8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH8Q9NYR8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH8Q9NYR8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms