Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1Q9NXJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGPEP1Q9NXJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1Q9NXJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1Q9NXJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1Q9NXJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGPEP1Q9NXJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGPEP1Q9NXJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGPEP1Q9NXJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PGPEP1Q9NXJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PGPEP1Q9NXJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGPEP1Q9NXJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGPEP1Q9NXJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PGPEP1Q9NXJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGPEP1Q9NXJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PGPEP1Q9NXJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PGPEP1Q9NXJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PGPEP1Q9NXJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGPEP1Q9NXJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGPEP1Q9NXJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms